Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCARF1Q14162 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SCARF1Q14162 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCARF1Q14162 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARF1Q14162 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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