Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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