Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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GTF3C1Q12789 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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GTF3C1Q12789 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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GTF3C1Q12789 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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GTF3C1Q12789 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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GTF3C1Q12789 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
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GTF3C1Q12789 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
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GTF3C1Q12789 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
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GTF3C1Q12789 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
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GTF3C1Q12789 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
GTF3C1Q12789 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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GTF3C1Q12789 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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GTF3C1Q12789 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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