Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CKAP4Q07065 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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CKAP4Q07065 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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CKAP4Q07065 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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CKAP4Q07065 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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CKAP4Q07065 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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CKAP4Q07065 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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CKAP4Q07065 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CKAP4Q07065 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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