Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
RABGGTBP53611 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RABGGTBP53611 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RABGGTBP53611 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RABGGTBP53611 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RABGGTBP53611 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RABGGTBP53611 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RABGGTBP53611 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
RABGGTBP53611 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RABGGTBP53611 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RABGGTBP53611 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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RABGGTBP53611 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RABGGTBP53611 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RABGGTBP53611 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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RABGGTBP53611 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RABGGTBP53611 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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RABGGTBP53611 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RABGGTBP53611 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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RABGGTBP53611 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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RABGGTBP53611 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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RABGGTBP53611 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RABGGTBP53611 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RABGGTBP53611 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RABGGTBP53611 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RABGGTBP53611 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RABGGTBP53611 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RABGGTBP53611 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RABGGTBP53611 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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