Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VDRP11473 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VDRP11473 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VDRP11473 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VDRP11473 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VDRP11473 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VDRP11473 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VDRP11473 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
VDRP11473 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VDRP11473 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VDRP11473 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VDRP11473 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VDRP11473 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VDRP11473 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VDRP11473 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VDRP11473 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VDRP11473 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VDRP11473 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VDRP11473 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VDRP11473 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VDRP11473 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VDRP11473 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VDRP11473 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VDRP11473 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VDRP11473 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VDRP11473 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
VDRP11473 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VDRP11473 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VDRP11473 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VDRP11473 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VDRP11473 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VDRP11473 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VDRP11473 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VDRP11473 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VDRP11473 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VDRP11473 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VDRP11473 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
VDRP11473 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
VDRP11473 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VDRP11473 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VDRP11473 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VDRP11473 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VDRP11473 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VDRP11473 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VDRP11473 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VDRP11473 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VDRP11473 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VDRP11473 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VDRP11473 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VDRP11473 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VDRP11473 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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VDRP11473 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VDRP11473 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VDRP11473 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VDRP11473 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VDRP11473 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VDRP11473 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VDRP11473 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VDRP11473 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VDRP11473 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VDRP11473 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VDRP11473 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VDRP11473 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VDRP11473 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VDRP11473 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VDRP11473 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VDRP11473 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VDRP11473 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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