Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDX54Q8TDD1 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDX54Q8TDD1 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.21
DDX54Q8TDD1 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX54Q8TDD1 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX54Q8TDD1 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX54Q8TDD1 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX54Q8TDD1 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX54Q8TDD1 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX54Q8TDD1 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX54Q8TDD1 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX54Q8TDD1 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX54Q8TDD1 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX54Q8TDD1 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
DDX54Q8TDD1 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.2 ms