Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SAMD1Q6SPF0 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SAMD1Q6SPF0 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SAMD1Q6SPF0 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD1Q6SPF0 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD1Q6SPF0 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD1Q6SPF0 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD1Q6SPF0 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SAMD1Q6SPF0 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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