Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
C9orf135Q5VTT2 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.03□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
C9orf135Q5VTT2 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
C9orf135Q5VTT2 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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