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Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1
TPRN, Taperin, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
TPRN
Q4KMQ1
MIR4714-201
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BASIC
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□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-1255P-201
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112 nt
BASIC
0.89
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
SNORA2A-201
ENST00000383885
135 nt
BASIC
0.89
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
MIR193B-201
ENST00000384907
83 nt
BASIC
0.89
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
RNA5SP292-201
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118 nt
BASIC
0.89
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
MIR4796-201
ENST00000580742
81 nt
BASIC
0.89
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
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ENST00000603259
279 nt
BASIC
0.89
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
IGLL4P-201
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133 nt
BASIC
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□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
MIR6866-201
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69 nt
BASIC
0.89
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
AC090625.1-201
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210 nt
BASIC
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□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
SNORA63.2-201
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126 nt
BASIC
0.88
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
SNORD44.1-201
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61 nt
BASIC
0.88
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
MIR6513-201
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64 nt
BASIC
0.88
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
CCDC7-215
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4158 nt
APPRIS ALT2
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-351P-201
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100 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
MIR4460-201
ENST00000577862
86 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
AC069503.3-201
ENST00000618674
145 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
TRAJ61-201
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60 nt
APPRIS P1
BASIC
0.86
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
AC006210.1-201
ENST00000424882
111 nt
BASIC
0.86
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
MIRLET7D-201
ENST00000362263
87 nt
BASIC
0.85
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
RNY1P1-201
ENST00000364372
112 nt
BASIC
0.85
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
MIR450A2-201
ENST00000385022
100 nt
BASIC
0.85
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
LINC00345-201
ENST00000443679
285 nt
TSL 5
BASIC
0.85
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
RNA5SP484-201
ENST00000458857
111 nt
BASIC
0.85
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
AC093729.1-201
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128 nt
BASIC
0.85
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
MIR1273G-201
ENST00000577677
100 nt
BASIC
0.85
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
MIR6835-201
ENST00000621552
64 nt
BASIC
0.85
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-1051P-201
ENST00000365471
102 nt
BASIC
0.84
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
SNORD110-201
ENST00000408189
75 nt
BASIC
0.84
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
SNORA68.3-201
ENST00000515906
83 nt
BASIC
0.84
□□□□□ -2.27
TPRN
Q4KMQ1
C9orf84-203
ENST00000374287
4721 nt
APPRIS P3
TSL 5
BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-497P-201
ENST00000365316
104 nt
BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
MT-TY-201
ENST00000387409
66 nt
BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.593-201
ENST00000410292
98 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-229P-201
ENST00000516614
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
NAMPTP3-201
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224 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
RNU5F-1-201
ENST00000362507
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BASIC
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.68-201
ENST00000362881
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
SNORD115-27-201
ENST00000364430
82 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
RNU6ATAC31P-201
ENST00000408513
126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
MIR508-201
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BASIC
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
MIR936-201
ENST00000401264
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BASIC
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
MIR548O2-201
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70 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
uc_338.17-201
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179 nt
BASIC
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
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BASIC
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.423-201
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
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TPRN
Q4KMQ1
MIR548BB-201
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BASIC
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□□□□□ -2.28
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Q4KMQ1
AC010487.4-201
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BASIC
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-267P-201
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-820P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.28
TPRN
Q4KMQ1
MIR4752-201
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72 nt
BASIC
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TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.115-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
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124 nt
BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
RNA5SP347-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-1327P-201
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105 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.433-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.611-201
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108 nt
BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
RNU4ATAC4P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
RNU1-29P-201
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126 nt
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
MIR6755-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
MIR924-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
HAR1A.1-201
ENST00000459583
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
SNORA25.13-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
RNU7-153P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
SNORA70.25-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.426-201
ENST00000384068
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
snoMBII-202.2-201
ENST00000517263
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
RNU6ATAC17P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
AC006160.2-201
ENST00000637708
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
SAMD9-203
ENST00000620985
6754 nt
APPRIS P1
TSL 2
BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
SNORA9.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
RNA5SP62-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
MIR760-201
ENST00000390220
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.681-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
MIR4711-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
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BASIC
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□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
MIR5087-201
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BASIC
0.72
□□□□□ -2.29
TPRN
Q4KMQ1
RNA5SP128-201
ENST00000365305
116 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
TPRN
Q4KMQ1
RNA5SP395-201
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118 nt
BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-1052P-201
ENST00000411398
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BASIC
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□□□□□ -2.3
TPRN
Q4KMQ1
AL157398.1-201
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□□□□□ -2.3
TPRN
Q4KMQ1
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ENST00000516002
120 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
TPRN
Q4KMQ1
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BASIC
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□□□□□ -2.3
TPRN
Q4KMQ1
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BASIC
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□□□□□ -2.3
TPRN
Q4KMQ1
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108 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
TPRN
Q4KMQ1
MIR103A1-201
ENST00000362165
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□□□□□ -2.3
TPRN
Q4KMQ1
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BASIC
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□□□□□ -2.3
TPRN
Q4KMQ1
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107 nt
BASIC
0.69
□□□□□ -2.3
TPRN
Q4KMQ1
AC140658.3-201
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BASIC
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□□□□□ -2.3
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.125-201
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111 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.264-201
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TPRN
Q4KMQ1
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TPRN
Q4KMQ1
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BASIC
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□□□□□ -2.3
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Q4KMQ1
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BASIC
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□□□□□ -2.3
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Q4KMQ1
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BASIC
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□□□□□ -2.3
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Q4KMQ1
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107 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
TPRN
Q4KMQ1
RNA5SP330-201
ENST00000517096
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BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
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Q4KMQ1
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BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
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Q4KMQ1
SNORD114-4-201
ENST00000363962
75 nt
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
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