Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TPRNQ4KMQ1 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TPRNQ4KMQ1 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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