Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ZFHX3Q15911 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ZFHX3Q15911 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ZFHX3Q15911 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ZFHX3Q15911 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ZFHX3Q15911 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ZFHX3Q15911 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ZFHX3Q15911 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ZFHX3Q15911 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ZFHX3Q15911 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
ZFHX3Q15911 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
ZFHX3Q15911 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
ZFHX3Q15911 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
ZFHX3Q15911 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-2.41□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-2.43□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ZFHX3Q15911 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-2.48□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ZFHX3Q15911 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.2 ms