Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
HMGN3Q15651 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
HMGN3Q15651 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.74□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-3.74□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
HMGN3Q15651 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-3.81□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
HMGN3Q15651 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
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