Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRKQ15262 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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PTPRKQ15262 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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PTPRKQ15262 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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PTPRKQ15262 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
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PTPRKQ15262 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.08□□□□□ -2.58
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PTPRKQ15262 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
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PTPRKQ15262 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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PTPRKQ15262 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
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PTPRKQ15262 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRKQ15262 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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PTPRKQ15262 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
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