Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAPTM4AQ15012 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
LAPTM4AQ15012 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.7 ms