Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL19A1Q14993 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL19A1Q14993 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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