Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
CHD4Q14839 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHD4Q14839 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.5 ms