Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
MDC1Q14676 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
MDC1Q14676 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 632.7 ms