Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL9A2Q14055 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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COL9A2Q14055 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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COL9A2Q14055 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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COL9A2Q14055 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL9A2Q14055 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL9A2Q14055 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL9A2Q14055 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL9A2Q14055 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
COL9A2Q14055 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL9A2Q14055 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL9A2Q14055 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL9A2Q14055 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
COL9A2Q14055 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
COL9A2Q14055 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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