Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CACNA1CQ13936 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-0.97□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CACNA1CQ13936 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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