Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CBX3Q13185 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CBX3Q13185 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.4□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CBX3Q13185 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CBX3Q13185 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
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