Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
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TRAF1Q13077 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TRAF1Q13077 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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TRAF1Q13077 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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TRAF1Q13077 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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TRAF1Q13077 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAF1Q13077 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRAF1Q13077 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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TRAF1Q13077 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRAF1Q13077 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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