Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-5□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
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TFF3Q07654 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
TFF3Q07654 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
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TFF3Q07654 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TFF3Q07654 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
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TFF3Q07654 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
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TFF3Q07654 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
TFF3Q07654 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
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TFF3Q07654 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
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TFF3Q07654 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
TFF3Q07654 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
TFF3Q07654 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
TFF3Q07654 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-5.17□□□□□ -3.24
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