Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
CHRNEQ04844 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CHRNEQ04844 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHRNEQ04844 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.8 ms