Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PTPRBP23467 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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PTPRBP23467 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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PTPRBP23467 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRBP23467 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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PTPRBP23467 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
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PTPRBP23467 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
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PTPRBP23467 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
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PTPRBP23467 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRBP23467 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
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