Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF40AO75400 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF40AO75400 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF40AO75400 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRPF40AO75400 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRPF40AO75400 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF40AO75400 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF40AO75400 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF40AO75400 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF40AO75400 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF40AO75400 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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