Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
J3QKU1 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
J3QKU1 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
J3QKU1 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
J3QKU1 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
J3QKU1 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
J3QKU1 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
J3QKU1 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
J3QKU1 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
J3QKU1 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
J3QKU1 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
J3QKU1 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
J3QKU1 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
J3QKU1 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
J3QKU1 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
J3QKU1 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
J3QKU1 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
J3QKU1 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
J3QKU1 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
J3QKU1 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
J3QKU1 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
J3QKU1 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
J3QKU1 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
J3QKU1 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
J3QKU1 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
J3QKU1 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
J3QKU1 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
J3QKU1 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
J3QKU1 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
J3QKU1 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
J3QKU1 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
J3QKU1 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
J3QKU1 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
J3QKU1 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
J3QKU1 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
J3QKU1 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
J3QKU1 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
J3QKU1 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
J3QKU1 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
J3QKU1 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
J3QKU1 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
J3QKU1 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
J3QKU1 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
J3QKU1 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
J3QKU1 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
J3QKU1 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 295.6 ms