Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM53CQ9NYF3 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
FAM53CQ9NYF3 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.1 ms