Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF18Q99633 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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PRPF18Q99633 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF18Q99633 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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PRPF18Q99633 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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PRPF18Q99633 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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PRPF18Q99633 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRPF18Q99633 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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