Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
VAMP3Q15836 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
VAMP3Q15836 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.08□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
VAMP3Q15836 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
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