Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
HMGN3Q15651 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.62□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
HMGN3Q15651 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
HMGN3Q15651 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
HMGN3Q15651 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
HMGN3Q15651 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
HMGN3Q15651 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
HMGN3Q15651 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
HMGN3Q15651 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
HMGN3Q15651 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
HMGN3Q15651 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
HMGN3Q15651 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
HMGN3Q15651 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
HMGN3Q15651 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
HMGN3Q15651 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
HMGN3Q15651 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
HMGN3Q15651 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
HMGN3Q15651 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
HMGN3Q15651 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
HMGN3Q15651 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
HMGN3Q15651 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
HMGN3Q15651 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
HMGN3Q15651 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
HMGN3Q15651 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
HMGN3Q15651 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
HMGN3Q15651 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
HMGN3Q15651 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
HMGN3Q15651 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
HMGN3Q15651 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
HMGN3Q15651 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
HMGN3Q15651 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
HMGN3Q15651 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
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