Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SIX1Q15475 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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SIX1Q15475 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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SIX1Q15475 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
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SIX1Q15475 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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SIX1Q15475 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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SIX1Q15475 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SIX1Q15475 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SIX1Q15475 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SIX1Q15475 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SIX1Q15475 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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