Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PRPF4BQ13523 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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PRPF4BQ13523 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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PRPF4BQ13523 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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PRPF4BQ13523 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
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PRPF4BQ13523 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PRPF4BQ13523 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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PRPF4BQ13523 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PRPF4BQ13523 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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