Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SF3B2Q13435 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SF3B2Q13435 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SF3B2Q13435 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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