Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIM28Q13263 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRIM28Q13263 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.3 ms