Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CHD3Q12873 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHD3Q12873 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
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