Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ARHGEF3Q9NR81 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ARHGEF3Q9NR81 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ARHGEF3Q9NR81 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ARHGEF3Q9NR81 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ARHGEF3Q9NR81 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ARHGEF3Q9NR81 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ARHGEF3Q9NR81 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ARHGEF3Q9NR81 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ARHGEF3Q9NR81 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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ARHGEF3Q9NR81 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ARHGEF3Q9NR81 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ARHGEF3Q9NR81 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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