Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED9Q6R2W3 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED9Q6R2W3 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED9Q6R2W3 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED9Q6R2W3 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED9Q6R2W3 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED9Q6R2W3 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED9Q6R2W3 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED9Q6R2W3 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED9Q6R2W3 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED9Q6R2W3 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZBED9Q6R2W3 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.9 ms