Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZIC1Q15915 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZIC1Q15915 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.6 ms