Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
ZFHX3Q15911 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ZFHX3Q15911 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ZFHX3Q15911 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ZFHX3Q15911 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ZFHX3Q15911 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ZFHX3Q15911 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ZFHX3Q15911 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
ZFHX3Q15911 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.2 ms