Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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SCN9AQ15858 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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SCN9AQ15858 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SCN9AQ15858 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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