Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-3.39□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-3.4□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
HMGN3Q15651 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-3.43□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-3.45□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-3.45□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-3.46□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
HMGN3Q15651 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-3.48□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-3.51□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-3.52□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
HMGN3Q15651 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.4 ms