Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SURF1Q15526 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SURF1Q15526 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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