Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRIM25Q14258 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRIM25Q14258 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRIM25Q14258 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 301.8 ms