Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SF3B2Q13435 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SF3B2Q13435 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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