Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM28Q13263 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM28Q13263 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM28Q13263 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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