Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRAP18433 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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PTPRAP18433 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRAP18433 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
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PTPRAP18433 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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PTPRAP18433 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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PTPRAP18433 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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PTPRAP18433 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRAP18433 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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