Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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TMEM260Q9NX78 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
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TMEM260Q9NX78 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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TMEM260Q9NX78 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TMEM260Q9NX78 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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