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Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5
UBQLN4, Ubiquilin-4, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
UBQLN4
Q9NRR5
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□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.387-201
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102 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
MIR587-201
ENST00000384845
96 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
ZEB1-AS1-204
ENST00000450834
576 nt
TSL 3
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
RNU4ATAC9P-201
ENST00000517146
126 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
AC037487.3-201
ENST00000606668
112 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
AL138825.1-201
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192 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
CDKN3-212
ENST00000620759
196 nt
TSL 5
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
AC090617.8-201
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167 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
snoR1.1-201
ENST00000628177
80 nt
BASIC
-0.82
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-664P-201
ENST00000362381
107 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.57-201
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113 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD115-23-201
ENST00000364461
82 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.247-201
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92 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-1082P-201
ENST00000364574
107 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.315-201
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102 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD101-201
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73 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.514-201
ENST00000384528
112 nt
BASIC
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□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
MIRLET7B-201
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83 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
MT-TI-201
ENST00000387365
69 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-823P-201
ENST00000391042
103 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD77B-201
ENST00000391112
67 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
MIR8485-201
ENST00000401372
91 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.793-201
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111 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD57-201
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72 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
RNU7-152P-201
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64 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.632-201
ENST00000459189
102 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
RNY3P15-201
ENST00000516297
97 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
RNY3P16-201
ENST00000516338
101 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-521P-201
ENST00000516663
105 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
snoU83B.1-201
ENST00000517136
88 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
AC068339.1-201
ENST00000526965
141 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.19-201
ENST00000362462
99 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.78-201
ENST00000362970
110 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.84-201
ENST00000363011
104 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-770P-201
ENST00000363929
105 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.299-201
ENST00000364973
94 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-10P-201
ENST00000384036
107 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
MT-TL1-201
ENST00000386347
75 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-876P-201
ENST00000391295
104 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD2.1-201
ENST00000458762
69 nt
BASIC
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□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
RN7SKP19-201
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252 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-1338P-201
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91 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
IGHVII-40-1-201
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58 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
RNY1P9-201
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109 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
MIR4464-201
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92 nt
BASIC
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□□□□□ -2.54
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.173-201
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113 nt
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.244-201
ENST00000364484
109 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.495-201
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112 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-1215P-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.651-201
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103 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RRM2B-207
ENST00000519962
201 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
MIR4744-201
ENST00000581563
82 nt
BASIC
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
MIR1302-1-201
ENST00000637932
143 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-208P-201
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107 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-235P-201
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107 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNY1P11-201
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BASIC
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-990P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
MIR451A-201
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BASIC
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UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-578P-201
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103 nt
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-1246P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNU2-51P-201
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BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
MTND4LP30-201
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UBQLN4
Q9NRR5
RNY4P20-201
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BASIC
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UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-1057P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
KCNQ1OT1_5.1-201
ENST00000621902
226 nt
BASIC
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
MIR1255B1-201
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63 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
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111 nt
BASIC
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.44-201
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108 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.58-201
ENST00000362807
102 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-647P-201
ENST00000364243
107 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNY3P1-201
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102 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNU4-17P-201
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141 nt
BASIC
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
MIR1252-201
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65 nt
BASIC
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD2-201
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69 nt
BASIC
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD19B-201
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.659-201
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113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNU7-6P-201
ENST00000516845
62 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
SNORA40.15-201
ENST00000516884
107 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-1006P-201
ENST00000516998
103 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
AC108081.1-201
ENST00000604358
221 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
AC080013.6-201
ENST00000606185
215 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
MIR6888-201
ENST00000621977
67 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
MIR409-201
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79 nt
BASIC
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
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102 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.92-201
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102 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.235-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-309P-201
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106 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.306-201
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102 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.312-201
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BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.322-201
ENST00000365151
102 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
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102 nt
BASIC
-0.88
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UBQLN4
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□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-746P-201
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109 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-24P-201
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107 nt
BASIC
-0.88
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UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.579-201
ENST00000390939
94 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.590-201
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107 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-935P-201
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100 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
SNORA7.5-201
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110 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.650-201
ENST00000459002
102 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
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