Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VN1R3Q9BXE9 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
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VN1R3Q9BXE9 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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VN1R3Q9BXE9 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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VN1R3Q9BXE9 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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VN1R3Q9BXE9 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VN1R3Q9BXE9 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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VN1R3Q9BXE9 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VN1R3Q9BXE9 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VN1R3Q9BXE9 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VN1R3Q9BXE9 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VN1R3Q9BXE9 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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