Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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ZBED3Q96IU2 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
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ZBED3Q96IU2 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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ZBED3Q96IU2 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
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ZBED3Q96IU2 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ZBED3Q96IU2 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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